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Phénome : un réseau français de phénotypage végétal haut débit


France
April 11, 2013

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Le projet Phénome a pour ambition d’équiper la communauté scientifique française avec une infrastructure capable de mesurer, grâce à des méthodes précises et à haut débit, des caractères agronomiques de plantes soumises à divers scénarios de climats et d’itinéraires techniques associés au changement global. Ce projet, coordonné par l’Inra, a obtenu un financement de 24 M€ des Investissements d’Avenir. Le lancement du projet a eu lieu le 11 avril 2013.

Le phénotypage à haut débit est un verrou technologique à lever pour permettre la sélection de variétés moins consommatrices en intrants (eau, azote ou pesticides) dans le contexte d’une agriculture compétitive et plus respectueuse de l’environnement. Dans ce cadre, Phénome a pour ambition de fédérer un réseau de plateformes de phénotypage déjà existantes ou en cours d’élaboration sur cinq sites en France. Un fort investissement dans le développement de capteurs et de méthodes d’analyse de données sera aussi poursuivi. Le réseau servira la recherche française et européenne, et sera également ouvert à des partenaires privés (semenciers, instituts techniques…). Ce projet de 8 ans associe l’Inra, Arvalis-Institut-du-Végétal et le Cetiom.

Phénome comprend les infrastructures suivantes :

  • PhenoArch (Montpellier) et PPHD (Plateforme de phénotypage haut débit - Dijon) : deux plateformes en conditions contrôlées (capacité de 1900 plantes) avec des manipulations de l'état hydrique du sol, de la température et du CO2, et des mesures de la croissance des plantes, de leur architecture et leur transpiration
  • Cinq plateformes au champ (Ouzouer-le-Marché, Dijon, Clermont-Ferrand, Toulouse, Montpellier) : deux plateformes semi-contrôlées dont une avec un système FACE (Free-Air Carbon Enrichment) et des modules capables de contrôler la pluie (capacité de 800 micro parcelles). Elles sont équipées de capteurs du sol et du climat, et de robots qui peuvent imager les peuplements avec plusieurs longueurs d'onde. Trois plateformes au champ ont un débit supérieur aux précédentes (2000 micro parcelles). Elles sont équipées de capteurs du sol et du climat, ainsi que d'une 'phénomobile', véhicule autonome et équipé de capteurs capables de générer des images fonctionnelles à l'échelle de la micro parcelle.
  • De plus, deux plates-formes omiques, Phenics (Nantes) et Hit-Me (Bordeaux) permettent de centraliser et optimiser les mesures métaboliques et structurales à l'échelle du projet.

Plusieurs projets européens ou d’Investissements d’Avenir portés par l’Inra, comme DROPS, Breedwheat, Amaizing, Sunrise, Rapsodyn ou Peamust s’appuient déjà ou comptent s’appuyer sur cette infrastructure. Des collaborations sont en cours au niveau européen, notamment via le projet European Plant Phenotyping Network coordonné par le ICG Jülich (Allemagne), ainsi qu’avec le Centre Australien de phénomique (HRPPC, Canberra).
 



More news from: INRAE (Institut National de la Recherche Agronomique)


Website: https://www.inrae.fr

Published: April 11, 2013

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