Le Cirad a mis au point un test de détection de toutes les souches de la bactérie Xanthomonas axonopodis pv. allii chez l’oignon. Le test permettra de contrôler l’état sanitaire des semences au cours des échanges commerciaux.
La bactérie Xanthomonas axonopodis pv. allii provoque chez les alliacées, comme l’oignon, l’ail, le poireau, la ciboulette et l’échalote, des lésions sur les tissus aériens de la plante qui se met à dépérir. Les bulbes s’amoindrissent, ce qui entraîne des pertes de rendement allant de 10 à 50 %. Des recherches menées sur un test de détection de la bactérie dans les semences ont récemment abouti.
Ce test est capable de détecter toutes les souches de la bactérie. Il est environ trois fois plus sensible que les méthodes classiques avec un seuil d’une graine contaminée détectée sur 30 000. Il est en outre plus rapide car intégrant moins d’étapes : la bactérie n’a plus besoin d’être isolée et l’ADN extrait d’un macérat de semences est directement étudié par une double PCR.
La maladie est présente sur quasiment tous les continents et notamment dans le sud-ouest de l’Océan Indien, à l’île de la Réunion et à l’île Maurice. Le test permettra de contrôler l’état sanitaire des semences importées et produites localement. Cette méthode sera proposée comme méthode de référence européenne auprès de l’Organisation européenne et méditerranéenne de protection des plantes (OEPP), qui a inscrit la bactérie sur ses listes de quarantaine en 2009.
Références
Robène-Soustrade I., Legrand D., Gagnevin L., Chiroleu F., Laurent A., Pruvost O., 2010.
A multiplex nested PCR for detection of Xanthomonas axonopodis pv. allii from onion seeds
Applied and environmental microbiology, 76 : 2697-2703.
Brevet déposé en France le 21 octobre 2009 et extension PCT déposée le 21 octobre 2010.
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