Quatrième semencier mondial, Limagrain est un groupe coopératif international créé et dirigé par des agriculteurs français. Créateur et producteur de variétés végétales, Limagrain commercialise des semences de grandes cultures, des semences potagères et des produits céréaliers. HM.Clause, Business Unit du Groupe Limagrain, est un leader mondial innovant dans le développement, la production et la commercialisation de semences potagères. HM.Clause fait partie des cinq premières entreprises de semences potagères dans le monde. Avec plus de 2000 variétés dans plus de 20 cultures potagères, HM.Clause fournit des solutions innovantes aux producteurs à travers le monde.  

Référence : 2019-4884  

Famille de métier : R & D - Développement projets

Type de contrat : Stage

Temps de travail : Temps complet

Finalité du poste

Intégré(e) dans l'équipe de Bioinformatique et Biostatistique de La Bohalle, et en interaction étroite avec les équipes R&D de la société, vous réaliserez le développement d'un pipeline d'analyse de données NGS et de son déploiement au sein de la plateforme Galaxy de l'entreprise. Celui-ci s'intégrera dans la mise en place d'un processus d'optimisation de l'identification de variant d'intérêt agronomique.

Missions

Les principales missions de ce stage viseront à :

• Interagir avec les équipes impliquées pour mettre en place un workflow adaptés aux besoins.
• Participer au développement des outils et interfaces nécessaires au pipeline que vous aurez identifié.
• Veiller au respect des bonnes pratiques de développement permettant de faciliter la maintenance des outils réalisés.
• Communiquer avec les utilisateurs pour intégrer au mieux vos développement dans les processus déjà en place.
• Travailler au sein d'une équipe et communiquer efficacement avec des personnes aux profils variés.

Profil

Profil Etudiant en M2 de bioinformatique, vous avez des connaissances en génomique et génétique. Une maitrise correcte du langage python est attendue. Des connaissances de l'environnement Galaxy, de l'utilisation de Git et d'Unix seront les bienvenues.

Vos qualités d'organisation, votre autonomie, et vos compétences personnelles vous permettront de mener à bien ce stage dans un environnement dynamique et pluridisciplinaire.

Localisation du poste : La Bohalle, France

Critères candidat

Niveau d'études min. requis : Master ou équivalent
 

En savoir plus et postuler en ligne à 
https://talent.limagrain.com/Pages/Offre/detailoffre.aspx?idOffre=4884&idOrigine=3448&LCID=1036&offerReference=2019-4884